Voici le détail de commandement ainsi que les conventions de structure / dénomination pour chaque niveau de la Navy.
IMPERATOR
Chef de l'UEE.
HC LEGATUS NAVIUM ( HIGH COMMAND )
Le membre le plus haut gradé de la Navy et représente la branche du gouvernement. Il ou elle dicte la politique plus que le contrôle opérationnel.
GRAND ADMIRAL
Un président et les chefs d'état-major réunis en une seule personne, mais avec une autorité opérationnelle globale également.
MAJOR FLEETS
Portant les noms des constellations vues de la Terre, chaque flotte est commandée par un amiral, qui relève du Grand Admiral.
REGIONAL FLEET COMMANDER
Vice amiral qui supervise l’activité d’une fotte dans des régions spécifiques de la zone d'opération du Major Fleet. Nommé d'après les points de repère dans l'univers (par exemple, région Gamma, flotte de la Terre).
SPECIALTY GROUPS
Relevant de l'amiral de la flotte; le Group Commander (vice-amiral) surpervise tous les escadrons de chasseurs, contrôlant le pipeline de formation, supervisant les besoins de maintenance en matériel et en crédits, et affectant les nouveaux pilotes (nuggets) aux escadrons.
Voici les acronymes pour les types de groupes:
Intercept Fighter – IF
Intercept Bomber – IB
Strategic Bomber – SB
Electronic Warfare – EW
Search and Rescue – SR
Patrol/Reconnaissance – PR
BATTLE GROUP
Habituellement composé d'un transporteur principal, de 2 à 4 escortes et d'un nombre variable de gros vaisseaux de combat / soutien. Des chiffres sont utilisés pour les désigner (312th Battle Group). Ceux-ci sont commandés par un Rear Admiral (contre-amiral) qui relève du Regional Fleet Commander.
Désignations des vaisseaux capitaux:
CV = Fleet Carrier
CVE = Escort Carrier
BB = Battleship
CA = Cruiser
CB = Battlecruiser
DD = Destroyer
FF = Frigate
FFL = Frigate Light
K = Corvette
AP = Transport
AOG = Tanker
SQUADRONS
Les escadrons sont sous le commandement du Carrier Wing Commander qui est stationné sur le plus grand porte-vaisseaux du groupement tactique et relève du Rear Admiral. La Carrier Wing affectée au groupement tactique partage le numéro attribué au transporteur qui provient du premier vaisseau de la classe (déterminé au hasard), puis les vaisseaux suivants sont numérotés séquentiellement.
Les escadrons sont numérotés dans l'ordre dans lequel ils ont été créés et comprennent jusqu'à quatre escadrilles. En règle générale, chacune d’elles compte six vaisseaux, mais ce nombre peut varier en fonction de la disponibilité / des besoins.